中柱军负责汝宁府周边的防御和开封怀庆府以北对清军的防御。

上柱将军主事各重火器装备，驻军汝阳。

主将吴初，月芒将军衔，副将卢光祖、于大忠。

他们掌领原巴云军、岳云军一部、火炮军，共计四万兵马，统称上柱军。

上柱军负责夏王府所在地安全，配合各路大军的战斗。

在武臣六柱制中，周云在每柱中都混入各方军队势力，各柱麾下三大参将，必有一人来自其他派系。

这样，既能让他们互相制衡，又能相互协同，以达到尽快融合为一体的目的。

在设定武臣六柱将军制的同时，周云又设立了三符验兵和支粮制。

每柱调兵虎符皆缺角，调兵需同时持将军符（如北柱虎符）、军机符（如军机参赞院调兵令）、还须合王印方能生效。

支粮或军资需同时持军机参赞院的盐印，户部的粮印，工部的铁印，三印合一才能支取军资。

此外，周云还创立了军机参赞院，所有夏王府军政令皆出自此院。

院使为李岩兼吏部尚书，左副院使为陈金斗兼工部尚书，右副院使侯恂兼户部尚书，参赞顾君恩兼礼部尚书，参赞柳敬亭兼刑部尚书，参赞孙明远兼兵部尚书。

在此院中，周云充分平衡了各方势力，加入军方的孙明远，目的就是不让文臣一家独大，让各方势力都能受到制衡。

都察院中的左都御史为刘良佐兼，右都御史李真兼，左副都御史李仲卿兼，右副都御史苏崇贤兼。

向云总社其人员不变，继续由高云伍为副总社使，向云总社新增加了两个部门，宣传司和军事审理衙门。

至于暗影司，内卫司和亲卫营则由周云直辖。

内卫司辖下的羽云卫，周云将其扩编成两个军，共五万兵马，由侯贵统领，分散在每个府治，每府驻兵三千，协助地方官府维持治安。

针对黑云卫，周云扩充黑云卫到三千以上， 其职能为主要监察武将六柱各将领，持有可调动地方羽云卫的龙纹密令 ，另秘密要求所有将军亲兵必混入三成黑云卫。

暗影司则新设一部为驿传部，内设飞鸽传书，八百加急，烽火台，从登封至汝宁设三十六烽火台，夜间用三色灯笼传信，重要情报可使少林僧兵传递。

周云在军政权力架构设定之后，将军工，漕运等职责重新划分。